Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms