Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TSPAN13O95857 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TSPAN13O95857 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TSPAN13O95857 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TSPAN13O95857 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TSPAN13O95857 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TSPAN13O95857 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TSPAN13O95857 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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TSPAN13O95857 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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