Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD4O95243 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms