Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRD4O60885 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRD4O60885 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRD4O60885 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
BRD4O60885 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRD4O60885 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD4O60885 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms