Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EDIL3O43854 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms