Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms