Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF646O15015 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms