Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms