Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms