Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HNRNPCL3B7ZW38 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms