Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DXG7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DXG7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DXG7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms