Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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