Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms