Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms