Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USH1CQ9Y6N9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USH1CQ9Y6N9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USH1CQ9Y6N9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1CQ9Y6N9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms