Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAD1L1Q9Y6D9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAD1L1Q9Y6D9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms