Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y698

CACNG2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG2Q9Y698 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG2Q9Y698 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG2Q9Y698 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG2Q9Y698 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms