Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AUP1Q9Y679 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AUP1Q9Y679 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AUP1Q9Y679 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AUP1Q9Y679 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms