Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPTNQ9Y639 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTNQ9Y639 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms