Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX8Q9Y5X2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX8Q9Y5X2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 734 ms