Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX13Q9Y5W8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX13Q9Y5W8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX13Q9Y5W8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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