Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHGB5Q9Y5G0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHGB5Q9Y5G0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHGB5Q9Y5G0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms