Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB1Q9Y478 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB1Q9Y478 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAB1Q9Y478 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms