Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KNSTRNQ9Y448 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KNSTRNQ9Y448 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNSTRNQ9Y448 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNSTRNQ9Y448 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNSTRNQ9Y448 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNSTRNQ9Y448 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNSTRNQ9Y448 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KNSTRNQ9Y448 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KNSTRNQ9Y448 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KNSTRNQ9Y448 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
KNSTRNQ9Y448 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms