Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCN4Q9Y3Q4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCN4Q9Y3Q4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HCN4Q9Y3Q4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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