Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RRP7AQ9Y3A4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RRP7AQ9Y3A4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP7AQ9Y3A4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP7AQ9Y3A4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7AQ9Y3A4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7AQ9Y3A4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.5 ms