Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y345

SLC6A5, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A5Q9Y345 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A5Q9Y345 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A5Q9Y345 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A5Q9Y345 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms