Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRKHQ9Y2W6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRKHQ9Y2W6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRKHQ9Y2W6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRKHQ9Y2W6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms