Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B3Q9UQQ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B3Q9UQQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B3Q9UQQ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms