Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA1024Q9UPX6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA1024Q9UPX6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA1024Q9UPX6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA1024Q9UPX6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA1024Q9UPX6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA1024Q9UPX6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA1024Q9UPX6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms