Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM33Q9UPN9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM33Q9UPN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM33Q9UPN9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms