Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX6Q9UNH7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX6Q9UNH7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX6Q9UNH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX6Q9UNH7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX6Q9UNH7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms