Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDARQ9UNE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDARQ9UNE0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDARQ9UNE0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDARQ9UNE0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms