Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRQQ9UMZ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRQQ9UMZ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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