Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ZNF608Q9ULD9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ZNF608Q9ULD9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ZNF608Q9ULD9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ZNF608Q9ULD9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
ZNF608Q9ULD9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms