Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKLN1Q9UL63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKLN1Q9UL63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKLN1Q9UL63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms