Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR3Q9UJK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR3Q9UJK0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR3Q9UJK0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR3Q9UJK0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms