Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH22Q9UJ99 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH22Q9UJ99 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH22Q9UJ99 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms