Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN8Q9UBY8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN8Q9UBY8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms