Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPASTQ9UBP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPASTQ9UBP0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPASTQ9UBP0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPASTQ9UBP0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms