Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC4Q9UBN4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC4Q9UBN4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC4Q9UBN4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms