Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN10Q9UBB4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN10Q9UBB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATXN10Q9UBB4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN10Q9UBB4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms