Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C6orf48Q9UBA6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C6orf48Q9UBA6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms