Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00474Q9P2X8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00474Q9P2X8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms