Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR35Q9P2L0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR35Q9P2L0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR35Q9P2L0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR35Q9P2L0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms