Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL42Q9P2K6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL42Q9P2K6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL42Q9P2K6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL42Q9P2K6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms