Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PHRF1Q9P1Y6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHRF1Q9P1Y6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PHRF1Q9P1Y6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms