Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2L1Q9P0L9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2L1Q9P0L9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKD2L1Q9P0L9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2L1Q9P0L9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms