Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFA13Q9P0J0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA13Q9P0J0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA13Q9P0J0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA13Q9P0J0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms