Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP1Q9NZI2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNIP1Q9NZI2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP1Q9NZI2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms